Аллели, ассоциированные со слабой экспрессией А
Поможем в ✍️ написании учебной работы
Поможем с курсовой, контрольной, дипломной, рефератом, отчетом по практике, научно-исследовательской и любой другой работой
 

 

       

Фенотип

Аллель Замена нуклеотидов Замена аминокислот  

 

       

А3

A 3 -1 G 871 A Asp 291 Asn  

А3

A 3 -2

G 829 A, delC1060 5′ участок

Val 277 Met, Pro 354 FS

  сплайсинга в интроне 6                   A

finn

A x -1 T 646 A Phe 216 Ile                            

Ax

A x -2, -4, -5;

T 646 A, G 681 A, C 771 T, G 829 A

Phe 216 Ile, Val 277 Met

  A 1 -O 1v  

A

x

A x -3 A 297 G, T 646 A, G 681 A Phe 216 Ile, Val 277 Met                

 

         

A

x

B-O 1v-гибрид C 771 T, G 829 A Phe 216 Ile                

 

         

A

x

A x -6 G 996 A Thr 332 Стоп                

 

       

Ael

A el -1; A*109 + G G798-804 Phe 269, FS  

A

el

A el -2; A*110 C 467 T, G 829 A Pro 156 Leu, Phe 216 Ile              

 

           

A

w

A w -1 C 407 T, С 467 T, del C1060 Thr 136 Met, Pro 156 Leu                              

Aw

A w - 2

C 350 G, C 467 T, del C 1060

Pro 156 Leu, Gly 177 Ala,   Pro 354 FS  

A

   

A w -3

G 203 C, C 467 T, del C 1060

Arg 68 Thr, Pro 156 Leu,  

w

Pro 354 FS

           

 

           

A

w

A w -4 C 712 T Arg 241 Trp              

 

           

A

w

A w -5 A 965 G Glu 322 Gly              

 

       

Примечание. del – делеция, FS – изменение рамки считывания

 

 


 

115


Таблица 3.16

 



Аллели, ассоциированные со слабой экспрессией В

 

Фенотип

Аллель

Замена Замена  

нуклеотидов

аминокислот

 
       
           
B

3

B 3 -1 C 105 4T Arg 352 Trp  
         
B

x

B w -1 *B104 G 871 A Asp 291 Asn  
         
B

el

B el -1*B105 T 641 G Met 214 Arg  
         
B

el

B el -2 *B106 G 669 T Glu 223 Asp  
         
B

w

B w -2 C 873 G Asp 291 Glu  
         
B

w

B w -3 C 721 T Arg 241 Trp  
         
B

w

B w -4 A 748 G Asp 183 Gly  
         
B

w

B w -5 G 539 A Arg 180 His  
         
B

w

B w -6 A 1036 G Lys 346 Glu  
         
B

w

B w -7 G 1055 A Arg 352 Gln  
         
B

w

B w -8 T 863 G Met 288 Arg  
         

 

Высокая степень гомологии локуса АВО человека обнаружена также при сравнении с аналогичными локусами других млекопитающих: хомяков, крыс, мышей, овец, коров, кроликов, кошек и собак (Daniels [87], Roubinet и соавт. [190]). Интересная деталь: трансферазная активность локуса АВО у мышей вдвое выше, чем у человека (Roubinet и соавт. [190]).

 

Высокая степень подобия выявлена при секвенировании генов FUT1(Hh) и FUT2(Se) (табл. 3.17, см. рис. 3.8). Полагают, что локус FUT2 мог произойти в результате преобразования гена FUT1 (Daniels [87]).

 

Таблица 3.17

 

Аминокислотная последовательность гликозилтрансфераз у млекопитающих

 

Вид

Аллель, антиген, энзим

Высокогомологичный фрагмент аминокислотной

 

последовательности

   
       
Человек А101 FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYLGGFFGG 272  
Человек В101 FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYMGAFFGG 272  
         
Человек О01 FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYLGRFFGG 272  
         
Человек цис-АВ FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYLGAFFGG 272  
         
Мышь АВ FTYERRPQSQAYIPWDRGDFYYGGAFFGG 251  
         
Свинья А FTYERRPLSQAYIPRDEGDFYYAGGFFGG 282  
         
Собака Антиген Форссмана FPYERRHISTAFVAENEGDFYYGGAVFGG 267  
         
Мышь Галактозилтрансфераза FTYERRELSAAYIPFGEGDFYYHAAIFGG 312  
         
Корова Галактозилтрансфераза FTYERRKESAAYIPFGEGDFYYHAAIFGG 286  
         
Крыса IGb3 LPYERDKRSAAALSLSEGDFYYMAAVFGG 259  
         

 


 

116




АВО-генотипирование

 

Разработаны методы АВО-генотипирования с использованием полимеразной цеп-ной реакции (Gassner и соавт. [110], Misfud и соавт. [153], Stroncek и соавт. [206], Yip [239], Yoshida и соавт. [245]). Благодаря их использованию установлено более 140 от-личающихся аллелей АВО и более 20 аллелей Н (табл. 3.18, 3.19) (Seltsam и соавт. [193]). Изучение характера их распределения позволило выявить некоторые расо-вые и этнические особенности, которые серологическими методами не определяют-ся (Olsson и соавт. [175, 179]). Наибольшее число необычных аллелей АВО и Н выяв-лено среди монголоидов (Fukumori и соавт. [106], Ogasawara и соавт. [172], Yip [239]).

 

Таблица 3.18

 

Мутации гена FUT1, ассоциированные с Н-дефицитными фенотипами

 

Аллель Мутация Замена аминокислот
h 35 / 980 C 35 T, A 980 C Ala 12 Val Asn 327 Thr
h 349 C 349 T His 117 Tyr
h 442 G 442 T Asp 148 Tyr
h 460 T 460 C Tyr 154 His
h 460,1042 T 460 C, G 1042 A Tyr 154 His Glu 348 Lys
h 461 A 461 G Tyr 154 Cys
h 491 T 491 A Leu 164 His
h 513 G 513 C Trp 171 Cys
h 522 C 522 A Phe 174 Leu
h del547 / 548 del AG 547-552 Кодон 183 / 184
h 658 C 658 T Arg 220 Cys
h 659 G 659 A Arg 220 His
h 695 G 695 A Trp 232 стоп
h 721 T 721 C Tyr 241 His
h 725 T 725 G Leu 242 Arg
h 776 T 776 A Val 259 Glu
h 785,786 G 785 A C 786 A Ser 262 Lys
h 801 G 801 C или G 801 T Trp 267 Cys
h 826 C 826 T Gln 276 стоп
h 832 G 832 A Asp 278 Asn
h del880 / 881 Делеция TT 880-882 Кодон 274
h 944 C 944 T Ala 315 Val
h 948 C 948 G Tyr 316 стоп
h del960 / 970 Делеция CT 969, 970 Кодон 323 / 324
h del990 Делеция G 990 Кодон 330
h 1047 G 1047 C не выявлен Trp 349 Cys

 


 

117


Таблица 3.19

 

FUT2 - дефицитные аллели, ассоциированные с невыделительством

 

Аллели Мутации Замены аминокислот  
Se w385 A 385 T Ile 129 Phe  
se 428 G 428 A Trp 1435 стоп  
se 571 C 571 T Arg 191 стоп  
se 628 C 628 T Arg 210 стоп  
se 658 C 658 T Arg 220 стоп  
se 685 Делеция GTG 685 - 689 Делеция Val 229 или 230  
se 688 Делеция GTG 688 - 690 Делеция Val 230  

se 778

Делеция C 788

Изменение рамки считывания  

Pro 260, 275 стоп

 
     
       
se 849 G 849 A Trp 283 стоп  
se del Делеция экзона 2    
se fus Sec1- FUT2 слияние    

 

Примечание. стоп – прекращение синтеза полипептидной цепи после указанной позиции.

 



Дата: 2019-02-24, просмотров: 242.