Фенотип
А3
А3
A 3 -2
Val 277 Met, Pro 354 FS
finn
Ax
T 646 A, G 681 A, C 771 T, G 829 A
Phe 216 Ile, Val 277 Met
A
x
A
x
A
x
Ael
A
el
A
w
Aw
A w - 2
C 350 G, C 467 T, del C 1060
A
A w -3
G 203 C, C 467 T, del C 1060
w
Pro 354 FS
A
w
A
w
Примечание. del – делеция, FS – изменение рамки считывания
115
Таблица 3.16
Аллели, ассоциированные со слабой экспрессией В
Фенотип | Аллель | Замена | Замена | ||
нуклеотидов | аминокислот | ||||
B | 3 | B 3 -1 | C 105 4T | Arg 352 Trp | |
B | x | B w -1 *B104 | G 871 A | Asp 291 Asn | |
B | el | B el -1*B105 | T 641 G | Met 214 Arg | |
B | el | B el -2 *B106 | G 669 T | Glu 223 Asp | |
B | w | B w -2 | C 873 G | Asp 291 Glu | |
B | w | B w -3 | C 721 T | Arg 241 Trp | |
B | w | B w -4 | A 748 G | Asp 183 Gly | |
B | w | B w -5 | G 539 A | Arg 180 His | |
B | w | B w -6 | A 1036 G | Lys 346 Glu | |
B | w | B w -7 | G 1055 A | Arg 352 Gln | |
B | w | B w -8 | T 863 G | Met 288 Arg | |
Высокая степень гомологии локуса АВО человека обнаружена также при сравнении с аналогичными локусами других млекопитающих: хомяков, крыс, мышей, овец, коров, кроликов, кошек и собак (Daniels [87], Roubinet и соавт. [190]). Интересная деталь: трансферазная активность локуса АВО у мышей вдвое выше, чем у человека (Roubinet и соавт. [190]).
Высокая степень подобия выявлена при секвенировании генов FUT1(Hh) и FUT2(Se) (табл. 3.17, см. рис. 3.8). Полагают, что локус FUT2 мог произойти в результате преобразования гена FUT1 (Daniels [87]).
Таблица 3.17
Аминокислотная последовательность гликозилтрансфераз у млекопитающих
Вид | Аллель, антиген, энзим | Высокогомологичный фрагмент аминокислотной | ||
последовательности | ||||
Человек | А101 | FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYLGGFFGG | 272 | |
Человек | В101 | FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYMGAFFGG | 272 | |
Человек | О01 | FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYLGRFFGG | 272 | |
Человек | цис-АВ | FTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYLGAFFGG | 272 | |
Мышь | АВ | FTYERRPQSQAYIPWDRGDFYYGGAFFGG | 251 | |
Свинья | А | FTYERRPLSQAYIPRDEGDFYYAGGFFGG | 282 | |
Собака | Антиген Форссмана | FPYERRHISTAFVAENEGDFYYGGAVFGG | 267 | |
Мышь | Галактозилтрансфераза | FTYERRELSAAYIPFGEGDFYYHAAIFGG | 312 | |
Корова | Галактозилтрансфераза | FTYERRKESAAYIPFGEGDFYYHAAIFGG | 286 | |
Крыса | IGb3 | LPYERDKRSAAALSLSEGDFYYMAAVFGG | 259 | |
116
АВО-генотипирование
Разработаны методы АВО-генотипирования с использованием полимеразной цеп-ной реакции (Gassner и соавт. [110], Misfud и соавт. [153], Stroncek и соавт. [206], Yip [239], Yoshida и соавт. [245]). Благодаря их использованию установлено более 140 от-личающихся аллелей АВО и более 20 аллелей Н (табл. 3.18, 3.19) (Seltsam и соавт. [193]). Изучение характера их распределения позволило выявить некоторые расо-вые и этнические особенности, которые серологическими методами не определяют-ся (Olsson и соавт. [175, 179]). Наибольшее число необычных аллелей АВО и Н выяв-лено среди монголоидов (Fukumori и соавт. [106], Ogasawara и соавт. [172], Yip [239]).
Таблица 3.18
Мутации гена FUT1, ассоциированные с Н-дефицитными фенотипами
Аллель | Мутация | Замена аминокислот |
h 35 / 980 | C 35 T, A 980 C | Ala 12 Val Asn 327 Thr |
h 349 | C 349 T | His 117 Tyr |
h 442 | G 442 T | Asp 148 Tyr |
h 460 | T 460 C | Tyr 154 His |
h 460,1042 | T 460 C, G 1042 A | Tyr 154 His Glu 348 Lys |
h 461 | A 461 G | Tyr 154 Cys |
h 491 | T 491 A | Leu 164 His |
h 513 | G 513 C | Trp 171 Cys |
h 522 | C 522 A | Phe 174 Leu |
h del547 / 548 | del AG 547-552 | Кодон 183 / 184 |
h 658 | C 658 T | Arg 220 Cys |
h 659 | G 659 A | Arg 220 His |
h 695 | G 695 A | Trp 232 стоп |
h 721 | T 721 C | Tyr 241 His |
h 725 | T 725 G | Leu 242 Arg |
h 776 | T 776 A | Val 259 Glu |
h 785,786 | G 785 A C 786 A | Ser 262 Lys |
h 801 | G 801 C или G 801 T | Trp 267 Cys |
h 826 | C 826 T | Gln 276 стоп |
h 832 | G 832 A | Asp 278 Asn |
h del880 / 881 | Делеция TT 880-882 | Кодон 274 |
h 944 | C 944 T | Ala 315 Val |
h 948 | C 948 G | Tyr 316 стоп |
h del960 / 970 | Делеция CT 969, 970 | Кодон 323 / 324 |
h del990 | Делеция G 990 | Кодон 330 |
h 1047 | G 1047 C не выявлен | Trp 349 Cys |
117
Таблица 3.19
FUT2 - дефицитные аллели, ассоциированные с невыделительством
Аллели | Мутации | Замены аминокислот | |
Se w385 | A 385 T | Ile 129 Phe | |
se 428 | G 428 A | Trp 1435 стоп | |
se 571 | C 571 T | Arg 191 стоп | |
se 628 | C 628 T | Arg 210 стоп | |
se 658 | C 658 T | Arg 220 стоп | |
se 685 | Делеция GTG 685 - 689 | Делеция Val 229 или 230 | |
se 688 | Делеция GTG 688 - 690 | Делеция Val 230 | |
se 778 | Делеция C 788 | Изменение рамки считывания | |
Pro 260, 275 стоп | |||
se 849 | G 849 A | Trp 283 стоп | |
se del | Делеция экзона 2 | ||
se fus | Sec1- FUT2 слияние |
Примечание. стоп – прекращение синтеза полипептидной цепи после указанной позиции.
Дата: 2019-02-24, просмотров: 290.