Клонирование Rh-полипептидов
Поможем в ✍️ написании учебной работы
Поможем с курсовой, контрольной, дипломной, рефератом, отчетом по практике, научно-исследовательской и любой другой работой

 

56. 1990-х годах 2 лаборатории независимо друг от друга получили совершен-но одинаковые клоны кДНК полипептидов RhcЕ (Cherif-Zahar и соавт. [208], Avent и соавт. [148]).

 

Выделение кДНК, соответствующей полипептиду D, было осуществлено не-зависимо 3 исследовательскими группами (Le Van Kim и соавт. [418], Arce и со-авт. [138], Kajii и соавт. [390]). Последовательность аминокислот в белках, по-лученных при помощи кДНК RhD, отличалась от аминокислотной последова-тельности полипептида RhсЕ по 34–36 аминокислотным остаткам из 417 после-довательностей (рис. 4.7).


 

 

179


D             MSSKYPRSVR

RCLPLWALTL

 
cE          

50

- - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

 
                   
D

EAALILLFYF

FTHYDASLED

QKGLVASYQV

GQDLTVMAAI

GLGFLTSSFR

 
cE - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- - - - - - - - - L - - - - - - - N- -  
            100        
D

RHSWSSVAFN

LFMLALGVQW

AILLDGFLSQ

FPSGKVVITL

FSIRLATMSA

 
cE - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- - P- - - - - - -

- - - - - - - - - -

 
            150        
D

LSVLISVDAV

LGKVNLAQLV

VMVLVEVTAL

GNLRMVISNI

FNTDYHMNMM

 
cE M - - - - - AG- -

- - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- T - - - - - - - -

- - - - - - - - LR

 
            200        
D

HIYVFAAYFG

LSVAWCLPKP

LPEGTEDKDQ

TATIPSLSAM

LGALFLWIFW

 
cE -F - - - - - - - - -T - - - - - - - - - - K - - - - N - - R - - - - - - - - -

- - - - - - - M - -

 
            250        
D

PSFNSALLRS

PIERKNAVFN

TYYALVVSVV

TAISGSSLAH

PQGKISKTYV

 
cE - - V- - P - - - - - -Q- - - - M - - - - - - - A -

-300--

- - - - - - - - - - - - R - - -M - - -  
                   
D

HSAVLAGGVA

VGTSCHLIPS

PWLAMVLGLV

AGLISVGGAK

YLPGCCNRVL

 
cE - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- - - - -I - - - - C - - V - - - - - -  
            350        
D

GIPRSSIMGY

NFSLLGLLGE

IIYIVLLVLD

TVGAGNGMIG

FQVLLSIGEL

 
cE

- -R - I -V- HS

I - - - - - - - - - -T - - - - - - - R - - WN - - - - - -

- - - - - - - - - -

 
            400     417  
D

SLAIVIALTS

GLLTGLLLNL

KIWKAPHEAK

YFDDQVFWKF

PHLAVGF

 
cE - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - -

- - - - - - - V - -

- - - - - - - - - -

- - - - - - -

 

 

Рис. 4.7. Аминокислотная последовательность транскриптов гена D и cE по Mouro и соавт. [496] и Schenkel-Brunner [597]. Пунктир означает одинаковую аминокислотную последовательность сравниваемых полипептидов.

 

Полипептиды D и сЕ имеют высокую степень гомологии: клон полипепти-да D, выделенный Arce и соавт. [138], был на 96 % идентичен клону полипепти-да сЕ по последовательности нуклеотидов кДНК и на 92 % идентичен по струк-туре белка.

 

Le Van Kim и соавт. [418] показали, что полученные ими клоны кДНК явля-ются продуктом гена D, поскольку фрагменты геномной ДНК, с которыми со-впадали эти клоны, были получены от людей с фенотипом D +.

 

В то же время Kajii и соавт. [390] установили, что полученные ими клоны не были продуктом гена D, поскольку кДНК была идентифицирована у человека с фенотипом D −C +c + E +e + [390, 665, 666].

 

Данные о том, что у некоторых людей фенотип D − обусловлен делецией гена D, были получены Colin и соавт. [233] в экспериментах с использованием мето-да Саузерн-блот.

 



Клонирование Rh-гликопротеинов

 

Moore и Green [481] обнаружили, что в процессе иммунной преципита-ции полипептидов D и сЕ специфическими антителами одновременно с по­ липептидами преципитируются N-гликозилированные белки, получившие на-

 

звание RhAG (Rh-ассоциированные гликопротеины), или Rh-гликопротеины­. Компоненты этих белков, сопровождающие полипептиды D и еС, имели не-

 

сколько отличающуюся мол. массу, но одинаковую N-концевую­ аминокислот-ную последовательность [147].


 

180


Ridgwell и соавт. [565] клонировали фрагменты кДНК, соответствующие

 

Rh-связанному­ гликопротеину, и выделили кДНК полной длины из библио-теки кДНК костного мозга человека. Полученный Rh-гликопротеин содер-жал 409 аминокислот и имел, подобно полипептидам Rh, 12 мембранных до-менов с внутриклеточными N- и С-концевыми участками. Аминокислотная

 

последовательность Rh-гликопротеина­ и Rh-полипептида различалась. Сходство ограничивалось двумя аминокислотными остатками в первом и пя-том домене: Glu 13 и Glu 146 – в гликопротеине Rh, Glu 21 и Glu 146 – в по-липептиде Rh [565].

 



Структура генов RH

 

1972 г. Ruddle и соавт. [587] удалось определить, что генный локус систе-мы резус расположен на хромосоме 1. Затем он был картирован на коротком плече хромосомы в участке 1p34.3–p36.13 [211, 453, 462].

 

Когда была получена кДНК, соответствующая Rh-полипептидам, ее можно было использовать в качестве зонда в Саузерн-блоте для исследования геном-ной ДНК, т. е. определения структуры генов RH.

 

Результаты этих исследований подтвердили, что локус RH включает 2 очень похожих гена (СЕ и D), а один из этих генов отсутствует в гДНК, выделенной у нескольких неродственных лиц D − [233]. Таким образом была установлена мо-лекулярная основа общего для европеоидов фенотипа Rh −, который часто обу-словлен делецией гена D.

 

Ген D включает 10 экзонов и имеет организацию, похожую на структуру гена СЕ, но не идентичную ей (см. рис. 4.7).

 

Гены D и CE различаются по интрону 4 [138]. В гене СЕ имеется деле-ция 650 пар нуклеотидов, начинающаяся в интроне 4 от нуклеотида 181 [146]. Интрон 4 гена СЕ имеет 1976 пар нуклеотидов. Нуклеотиды в положении 1–181

831–1076 примерно идентичны в генах D и СЕ. Интрон 5 генов D и СЕ вклю-чает 1636 пар нуклеотидов. Имеется 29 нуклеотидных различий между этими двумя генами (98,2 % гомологии).

 

Организация гена СЕ исследована Cherif-Zahar и соавт. [209]. В связи с тем что антиген D обусловлен геном, отсутствующим у людей Rh −, определение молекулярной структуры антигенов Сс и Ее упростилось.

 

Mouro и соавт. [496] экстрагировали матричную РНК людей с редким фе-нотипом СсЕе и использовали синтетические олигонуклеотидные праймеры в присутствии обратной транскриптазы для получения кДНК полной длины, со-ответствующей продукту гена СЕ.

 

Присутствие антигенов Е и е было обусловлено заменой пролина на аланин

 

с позиции 226. Пролин в этой позиции придавал субстрату специфичность Е, аланин – специфичность е (см. рис. 4.5).

 

При сравнении кДНК лиц, содержащих антигены C и c, ситуация ока-залась сложнее. Наблюдали 6 различий в нуклеотидах, одна часть из кото-


 

181


рых (Cys 16, Ile 60, Ser 68, Ser 103) коррелировала с экспрессией C, другая (Trp 16, Leu 60, Asn 68, Pro 103) – с экспрессией с (hr') [496]. Эта находка была подтверждена амплификацией гДНК от людей с известным фенотипом: экзон 1 и 2 кодировал остатки, специфичные для антигенов Сс, а экзон 5 – специфичные для антигенов Ее.

 

Cherif-Zahar и соавт. [208] высказали предположение, что, хотя антигены Сс

 

В Ее являются продуктами одного и того же гена и кодированы одним видом мРНК, возможен альтернативный сплайсинг, формирующий несколько белков. Полипептид полной длины кодирует экспрессию антигенов Ее, а не Сс; сплай-сеоформа, в которой отсутствует экзон 5, кодирует экспрессию Сс, но не Ее. Гипотеза подтверждается тем фактом, что из препаратов мРНК людей Rh − мо-гут быть выделены разные продукты гена СЕ.

 

По мнению Umenishi и соавт. [666], сплайсеоформы не являются произво-дными гена СЕ; они могут также происходить от гена D. Некоторые сплайсео-формы выделены из незрелых эритробластов.

 

О экспериментах Smythe и соавт. [618] антигены с и Е были получены de novo на поверхности эритроидных клеток K562, в которые был введен ретро-вирус, комбинированный с кДНК, соответствующей сЕ-экспрессии. Поскольку использованная кДНК была полной длины, это отчетливо подтвердило, что ан-тигены с и Е находятся на одном и том же полипептиде.

 

Аминокислотная замена, определяющая Е- и е-специфичность [Pro 226 (ан-тиген Е), Ala 226 (антиген е)], находится в четвертой внеклеточной петле по-липептида СЕ. Эта локализация полностью соответствует серологическим раз-личиям антигенов Е и е. Однако антигенные различия обусловлены не толь-ко аминокислотной заменой, но и соответствующим молекулярным окружени-ем. Полипептид D также имеет остаток аланина в положении 226, но не несет е-антигенности.

 

Структура антигенов С и с сложнее, потому что полипептиды СЕ имеют 4 аминокислоты для антигена С и 4 – для антигена с, одна из которых [Ser 103 (антиген С) или Pro 103 (антиген с)] расположена на второй внеклеточной пет-ле полипептида.

 

Три из четырех аминокислот (Ile 60, Ser 68, Ser 103), которые отличают С-активный полипептид от с-активного, обнаружены также в D-полипептиде. Эти 3 аминокислоты кодируются экзоном 2 гена СЕ и экзоном 2 гена D. Не исключено, что именно благодаря этому подобию антигенов D и C антитела анти-D могут содержать анти-С-специфичность даже в тех случаях, когда эри-троциты, послужившие антигенным стимулом, не имели серологически выяв-ляемого антигена С, т. е. это был «чистый D». Во многом идентичная топология полипептидов, кодируемых генами D и CE, лежит в основе перекрестных реак-ций антигенов и антител системы резус.

 

Считается, что гены RH синтезируют полипептиды, несущие Rh-антигены­, не используя субстанций-предшественников.


 

182


Антиген D и его варианты

 

Антиген D (резус-антиген, резус-фактор, стандартный резус-антиген) после групповых антигенов А и В имеет наибольшее значение в трансфу­зиологии и акушерстве. Он присутствует у лиц с генотипом D / D и D / d. Как и другие Rh-антигены, антиген D содержится в мембране эритроцитов. Со слюной он не вы-деляется и в других жидкостях и тканях организма не представлен. Лица, не со-держащие антигена D, естественных антител против­ него, подобных групповым изогемагглютининам, не имеют.

 

Формирование эпитопов D кодируется экзонами 4 и 5 гена RHD. Avent и со-авт. [143], Huang [355] считают, что конверсия генов в этих экзонах обусловли-вает крайне низкую экспрессию D-антигена.

 

большинства людей D − имеется полная делеция гена RHD [138, 233, 368, 418, 616]. Соответствующего генетического эквивалента в виде d / d у них не найдено.

 

В редких случаях у людей D − наблюдали частичную делецию гена RHD [146, 368, 512], особенно среди лиц с фенотипом Cde, cdE, имевших экзоны RHD-гена, которые не были функциональными.

 

Описаны лица D– с генотипом Cde / Cde, имеющие практически сохранен-ный RHD-ген [137, 146]. У одного из этих лиц (рис. 4.8, строка Rо Har) полно-мерный ген RHD имел одну точку мутации С → Т в нуклеотиде 121, превра-щающую кодон глицина 41 в стоп-кодон [146]. Три другие мутации были об-наружены в RHD-транскриптах этого пробанда: в кодоне 215 – ТТС → СТС

 

(Phe → Leu), в кодоне 216 – TTG → CTG (Leu → Leu) и в кодоне 330 – TAC → CAC (Tyr → His).

 

другого человека было выпадение 4 нуклеотидов в секторе экзона 4 [137], что, как полагают авторы, могло привести к повреждению считывания нормаль-ного гена, в результате чего ген не проявлял себя фенотипически.

 

Иммунодоминантные протеины D + и D − отличаются 36 аминокислотными заменами, из которых 8 расположены на внеклеточных гидрофильных­ петлях протеина в позиции 169, 170, 172, 233, 238, 350, 353, 354. Эти замены с их моле-

кулярным окружением, по-видимому, и являются D-несущими­ детерминантами, способными связываться с анти-D-антителами.

 

Green [319], Le Van Kim и соавт. [418], Schmitz и соавт. [600] полагали, что экспрессию антигенов D, C и с обусловливает цистеиновый остаток, располо-женный экзофациально в позиции 285.

 

Suyama и соавт. [646] не разделяли эту точку зрения, предположив, что Cys 285 не является определяющим в экспрессии антигена D.

 

Smythe и соавт. [618] применили трансфекцию генов RH в клетки K562, что-бы экспрессировать антигены Rh. В некоторые клетки К562 вводили мутантный ген D, кодирующий в позиции 285 аланин вместо цистеина. Трансфектные клет-ки экспрессировали одно и то же количество D-анти­гена независимо от того, что кодировала вживляемая кДНК в позиции 285 – цистеин или аланин.


 

183


 

Рис. 4.8. Гибридные гены парциальных антигенов D. Темные прямоугольники – экзоны гена RHD, светлые прямоугольники – экзоны гена RHCE. Бук-вами справа обозначен антигенный комплекс, коди-руемый данным геном.

 







Экспрессия антигена D

 

Выраженность антигена D на эритроцитах не является константной величи-ной и меняется в широких пределах: от очень сильной до очень слабой, с тру-дом выявляемой. Во многом она зависит от сочетания факторов Rh, имеющих-ся у человека.

 

Считается, что отсутствие одних антигенов Rh сопровождается повышен-ным синтезом других, чтобы обеспечить формирование полноценной клеточ-ной мембраны. Так, в отсутствие полипептидов, несущих антигены Сс, ген RHD производит дополнительное число полипептидов D, восполняя таким обра-зом нехватку структурных элементов в мембране клетки. Высказывалось пред-положение, что сильный D-антиген на таких клетках обусловлен отсутствием конкуренции генов Сс и Ее в освоении общей для них и гена D субстанции-предшественника. При делеции гена D компенсаторную функцию берут на себя гены RHCE, нарабатывая большее, чем обычно, количество СЕ-полипептидов.


 

184


Имеются и другие предположения относительно неодинаковой экспрес-сии антигена D у разных индивидов, например CDe и cDE. В частности, по-липептиды Се и се, переплетающиеся в оболочке эритроцита с полипептида-ми D, затрудняют доступ анти-D-антител к участкам D-антигена, в результа-те чего создается видимость слабого реагирования эритроцитов D + с анти-D-сыворотками. При отсутствии полипептидов Се и се в оболочке эритроцитов связыванию D-антигенов с анти-D-антителами ничто не мешает, и реакция вы-глядит более сильной, хотя на тех и на других эритроцитах могло присутство-

 

вать одинаковое количество антигенных детерминант. Полипептиды­ сЕ в мень-шей степени блокируют доступ антител к D-антигену, чем белки, несущие Се-антигены, вследствие чего антиген D выражен сильнее, когда он находится в комбинации с антигеном сЕ, и менее выражен – в комбинации с антигеном Се.

 

Следует также иметь в виду, что антигенные участки подсчитывают по коли-честву связавшихся с ними антител и это не всегда отражает истинное их число. Скрытые от доступа антител участки, расположенные в толще мембраны, а воз-можно, и на эндоцеллюлярной ее части, могут оставаться не учтенными.

 

На выраженность антигена D влияет ген С, ингибирующий в положении транс продукцию полипептидов D (см. D u). Ингибирующий эффект гена С на ген D проявляется и в положении цис. Так, по данным Rochna и Huges-Jones [568], эритроциты лиц CDe / cde содержат меньше антигенных участков D, чем эритроциты лиц cDE / cde, у которых ген С отсутствует.

 

Первое место по количеству серологически активных D-антигенных участ-ков на поверхности клетки (до 200 тыс. на 1 клетку) занимают эритроциты го-мозигот −D −/ −D − и *D*/*D* (табл. 4.10). Антиген D на этих клетках выражен столь сильно, что многие сыворотки анти-D с неполными антителами агглю-тинируют эти эритроциты в солевой среде подобно полным агглютининам. По силе реакции эти эритроциты напоминают клетки, обработанные протеолитиче-скими ферментами. Последние удаляют с эритроцитов белки, препятствующие взаимодействию Rh-антигенов с неполными антителами. Эритроциты гетерози-гот  −D −/СDе и *D*/СDе реагируют с неполными антителами слабее. Не все сы-воротки, агглютинирующие эритроциты гомозигот, способны агглютинировать эритроциты гетерозигот. Эритроциты с другими генотипами, представленными на рис. 4.9, не агглютинируются неполными антителами в солевой среде.

 

у лиц (C)D(e), имеющих сниженную экспрессию (С) и (е), содержится мень-ше серологически активного D-антигена, чем у лиц −D − и *D*, однако суще-ственно больше, чем у гомозигот сDE / cDE. Далее в соответствии с рис. 4.9 выраженность D-антигена на эритроцитах убывает в последовательности: cDE / CDe > cDe / cde > CDe / CDe > cDE / cde > CDe / cde > Cde / cDe. Последний ге-

 

нотип, Cde / cDe, в котором C и D находятся в позиции транс, нередко представ-ляет собой Cde / cD u e, продуцирующий слабый антиген Du. Эритроциты Du мо-гут нести менее 500 D-антигенных участков, что находится на грани выявления даже такой чувствительной методикой, как непрямая проба Кумбса.


 

185


           

Таблица 4.10

 




Дата: 2019-02-24, просмотров: 238.