Подвижные эл-ты:
· IS-элементы
· Транспозоны
· Нек. бактериофаги. У 24% секв геномов прокариот – нет.
Мобильный элемент встроился в ген – инактивация. Перед – изм регуляции. Делеции при транспозиции IS:
· Как при внутримолекулярной эктопической рекомбинации. В роли прямых повторов - IS
· Если IS смотрят друг на друга, то инверсия участка м/у.
· Межмол рекомбинация
· Фрагмент ДНК (норм размера), фланк 2 идент IS элементами, способен к транспозиции. Обладает всем, чем нужно.
Гор перенос генов – процесс передачи ген материала другому организму – непотомку.
Вопрос №42.
Подвижные элементы прокариот: структурная организация и механизм транспозиции IS-элементов и составных транспозонов.
IS: 800-2500 пн. Инвертированные повторы по краям (9-40 пн). Частота транспозиции 10^-4 -- 10^-7
Прямые повторы мишени: 2-14 пн.
У 6/7 повторы не совершены.
Составные транспозоны: из 2 IS-элементов в противоположной ориентации отн друг друга. Они фланкируют центр часть, где лежат посторонние гены. Пример: Tn10
Механизм: консервативный – вырезание-вставка.
Вопрос №43
Подвижные элементы прокариот: структурная организация и механизм транспозиции несоставных (комплексных) транспозонов.
Центральная часть содержит гены, необх для транспозиции и другие гены. Фланк короткими инвертированными поворами. Пример: Tn3 Механизм: репликативный
1. Транспозаза делает однонитевые надрезы на концах Tn-элемента и ДНК-мишени.
2. Свободные концы Tn соединяются со свободными концами мишени. Восьмёрка.
3. Репликация на однонитевых матрицах, начинается со свободных концов, продолжается через Tn-элемент и ДНК-мишень.
4. Образуется коинтеграт: 2 копии сайта встраивания и Tn-элемента.
5. М/у сайтами внутри Tn-элементов происходит сайт-специфическая рекомбинация – 2 исходных репликона.
6. Новая копия Tn-элемента фланкирована прямыми повторами ДНК-мишени.
Вопрос №44.
Подвижные элементы эукариот: ДНК-транспозоны. Структура элементов Ac и Ds у кукурузы и их роль в мозаицизме окраски зерна.
ДНК-транспозоны – элементы прокариотического типа. Транспозиция по консервативному механизму.
Кукуруза: Ас – автономный элемент (активатор). Ds – неавтономный элемент, чьё перемещение обусловлено активатором.
Ас – 4563 п.н. Ген транспозазы из 6 интронов и 5 экзонов. Потом инвертированные (11 пн), совсем по краям – прямые (8пн). Ds – то же, но с делециями в гене транспозазы.
Ас-Dc-С-локус. В С-локусе ген биосинтеза антоциана. Под действием активатора Dc может разбить ген. Зерно желтое. Потом покидает ген, появляются фиолетовые пятна. Маленькие – вырезание поздно. Большие – рано. Все фиолетовые –в половой клетки.
Вопрос №45
Подвижные элементы эукариот: ретротранспозоны (ретроэлементы). Механизм транспозиции ретротранспозонов.
Транспозиция ретроэлементов осуществляется через РНК-интермедиат. ДНК синтез с РНК обр транскриптазой. Механизм:
1. С геномной копии – РНК
2. На ней ДНК обр транскриптазой
3. Вторая цепь ДНК
4. Встраивается в хр-му инсертазой.
Вопрос №46.
Подвижные элементы эукариот: структурная организация LTR-ретротранспозонов на примере ретротранспозона Ty1 дрожжей.
LTR – с длинными концевыми повторами. Как ретровирус, но без белка вирусной оболочки.
Ty1 – прим 5900 нкт. LTR-какая-то херня (дуплиц повтор?)-gag-pol-LTR
LTR – прямые концевые повторы (330 пн). Дупл повтор ДНК-мишени – 5 пн Примерно 30 копий в геноме дрожжей, 10:-4 за генерацию. У человека свыше 100 тыс копий LTR, у высших растений ок 1млн.
Gag – капсид-подобный белок. Pol: prot, int (интеграза), RT (обр. транскриптаза). Обратная транскрипция в цитоплазме.
Вопрос №47.
Подвижные элементы эукариот: сравнительная характеристика не-LTR ретротранспозонов SINE и LINE.
Нет длинных инв. повторов. Не кодируют транспозиц интегразу.
SINE | LINE |
300 пн | 6500 пн |
Неавтономные | Автономные |
У человека 1.5 млн копий | У человека 850 тыс копий |
Транспорт за счёт белков LINE | Транспозиция через РНК, синхронно с интеграцией |
Не кодируют белки | Кодируют ORF1 и ORF2 (pol): EN – эндонуклеаза RT – обр транскр. |
Вопрос №48.
Дата: 2019-02-02, просмотров: 814.