В отдельных случаях при наступлении определенных событий либо для достижения конкретных целей природоресурсное законодательство предусматривает ограничение или приостановление прав природопользователей.

Так, ст. 56 Земельного кодекса РФ допускает, что права на землю могут быть на основании решений исполнительных органов государственной власти, органов местного самоуправления или судов ограничены бессрочно или на определенный срок в связи с необходимостью соблюдения особых условий использования земельных участков и режима хозяйственной деятельности в охранных и санитарно-защитных зонах; особых условий охраны окружающей среды, в т.ч. животного и растительного мира, памятников природы, истории и культуры, археологических объектов, сохранения плодородного слоя почвы, естественной среды обитания, путей миграции диких животных, и в других установленных федеральными законами случаях.

Согласно ст. 20 Закона РФ «О недрах» право пользования недрами может быть досрочно прекращено, приостановлено или ограничено органами, предоставившими лицензию, в случаях возникновения непосредственной угрозы жизни или здоровью людей, работающих или проживающих в зоне влияния работ, связанных с пользованием недрами; нарушения пользователем недр существующих условий лицензии; систематического нарушения пользователем недр установленных правил пользования недрами; возникновения чрезвычайных ситуаций; если пользователь в течение установленного в лицензии срока не приступил к пользованию недрами в предусмотренных объемах; ликвидации предприятия или иного субъекта хозяйственной деятельности, которому недра были предоставлены в пользование; по инициативе владельца лицензии.

В силу ст. 41 нового Водного кодекса РФ использование отдельных водных объектов или их частей может быть ограничено или приостановлено в случаях угрозы причинения вреда жизни или здоровью человека; возникновения радиационной аварии или иных чрезвычайных ситуаций природного или техногенного характера; причинения вреда окружающей природной среде; в иных предусмотренных федеральными законами случаях.

Меры по приостановлению водопользования в случаях, предусмотренных Кодексом об административных правонарушениях РФ, принимаются на основании решений суда. В иных случаях приостановление водопользования осуществляется исполнительными органами государственной власти или органами местного самоуправления в пределах их компетенции.

Ограничение водопользования устанавливается нормативно-правовыми актами исполнительных органов государственной власти, нормативно-правовыми актами органов местного самоуправления или решением суда.

Ст. 27 Лесного кодекса РФ предусматривает, что права пользования участками лесного фонда могут быть ограничены или приостановлены решениями федерального органа исполнительной власти по надзору в сфере природопользования или его территориальных органов в случаях нарушения лесопользователем требований лесного законодательства РФ; невыполнения лесопользователем условий лесорубочного билета, ордера, лесного билета.

В ст. 14 ФЗ «Об охране атмосферного воздуха» закреплено, что выбросы вредных (загрязняющих) веществ в атмосферный воздух и вредное физическое воздействие на него могут быть ограничены, приостановлены или прекращены при отсутствии разрешений на выбросы вредных (загрязняющих) веществ в атмосферный воздух и вредные физические воздействия на атмосферный воздух; нарушении условий, предусмотренных соответствующими разрешениями.

Ст. 18 ФЗ «Об отходах производства и потребления» содержит общее требование о том, что при нарушении нормативов образования отходов и лимитов на их размещение деятельность индивидуальных предпринимателей и юридических лиц в области обращения с отходами может быть ограничена, приостановлена или прекращена.