Минприроды России является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере изучения, использования, воспроизводства и охраны природных ресурсов, включая недра, водные объекты, леса, объекты животного мира и среду их обитания, земельных отношений, связанных с переводом земель водного фонда, лесного фонда и земель особо охраняемых территорий и объектов (в части, касающейся земель особо охраняемых природных территорий) в земли другой категории, в области лесных отношений, в области охоты, в сфере гидрометеорологии и смежных с ней областях, мониторинга окружающей природной среды, ее загрязнения, в том числе в сфере регулирования радиационного контроля и мониторинга, а также по выработке и реализации государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере охраны окружающей среды, включая вопросы, касающиеся обращения с отходами производства и потребления (далее - отходы), особо охраняемых природных территорий и государственной экологической экспертизы.

Министерство осуществляет свои полномочия непосредственно либо через свои территориальные органы (в том числе бассейновые управления и подведомственные организации).

Решения Минприроды России и его территориальных органов обязательны для органов исполнительной власти, недро- и водопользователей.

В ведении Минприроды России находятся следующие федеральные службы и федеральные агентства, осуществляющие государственные функции в сфере природопользования:

а) Росгидромет – осуществляет функции по управлению государственным имуществом и оказанию государственных услуг в области гидрометеорологии и смежных с ней областях, мониторинга состояния и загрязнения окружающей среды, государственному надзору за проведением работ по активному воздействию на метеорологические и другие геофизические процессы (см. Положение о Федеральной службе по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды, утвержденное постановлением Правительства РФ от 23.07.2004 № 372). Данная Служба осуществляет, в частности, государственный учет поверхностных вод и ведение государственного водного кадастра в части поверхностных водных объектов, ведение Единого государственного фонда данных о состоянии окружающей среды, ее загрязнении, государственный мониторинг атмосферного воздуха, водных объектов, континентального шельфа, состояния исключительной экономической зоны России;

б) Росприроднадзор – осуществляет функции по контролю и надзору в сфере природопользования, а также в пределах своей компетенции в области охраны окружающей среды, в том числе в части, касающейся ограничения негативного техногенного воздействия, в области обращения с отходами и государственной экологической экспертизы (см. Положение о Федеральной службе по надзору в сфере природопользования, утвержденное постановлением Правительства РФ от 30.07.2004 г. № 400). Росприроднадзор осуществляет, в частности, государственный контроль и надзор в области охраны, использования и воспроизводства объектов животного мира, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения, а также среды их обитания, за геологическим изучением, рациональным использованием и охраной недр, за использованием и охраной водных объектов, за рациональным использованием минеральных и живых ресурсов на континентальном шельфе, государственный земельный контроль в пределах свих полномочий за соблюдением требований законодательства РФ в области охраны окружающей среды, в том числе охраны атмосферного воздуха и обращения с отходами, за использованием, охраной, защитой и воспроизводством лесов на землях особо охраняемых природных территорий федерального значения;

в) Росводресурсы – выполняет функции по оказанию государственных услуг и управлению федеральным имуществом в сфере водных ресурсов (см. Положение о Федеральном агентстве водных ресурсов, утвержденное постановлением Правительства РФ от 16.06.2004 № 282). Данное Агентство организует территориальное перераспределение стока поверхностных вод, пополнение водных ресурсов подземных водных объектов, принимает меры по предотвращению негативного воздействия вод и ликвидации его последствий в отношении водных объектов, находящихся в федеральной собственности и расположенных на территориях двух и более субъектов РФ, осуществляет мероприятия по охране водоемов, предотвращению их загрязнения, засорения и истощения вод, по ликвидации последствий данных явлений;

г) Роснедра – осуществляет функции по оказанию государственных услуг и управлению государственным имуществом в сфере недропользования (см. Положение о Федеральном агентстве по недропользованию, утвержденное постановлением Правительства РФ от 17.06.2004 № 293). Данное Агентство организует государственное геологическое изучение недр, проведение геолого-экономической и стоимостной оценки месторождений полезных ископаемых и участков недр, проведение в установленном порядке конкурсов и аукционов на право пользования недрами, принятие решений о предоставлении права пользования участками недр в установленном законодательством РФ порядке, выдачу, оформление и регистрацию лицензий на пользование участками недр, а также переоформление таких лицензий;

д) Рослесхоз – осуществляет функции по контролю и надзору в области лесных отношений (за исключением лесов, расположенных на особо охраняемых природных территориях), а также по оказанию государственных услуг и управлению государственным имуществом в области лесных отношений (см. постановление Правительства РФ от 23.09.2010 № 736 "О Федеральном агентстве лесного хозяйства").

За нарушение законодательства в сфере природопользования установлена административная ответственность (гл. 8 КоАП).