В основе микробиологической диагностики острых кишечных инфекций лежит бактериологический метод, который заключается в выделении из исследуемого материала чистой культуры возбудителя и его идентификации на основе изучения различных свойств. Кроме бактериологического, применяют и серологический метод, заключающийся в обнаружении специфических антител в сыворотке больно го с помощью различных серологических реакций. Иногда применяются другие методы исследования.

Исследуемые материалы: выделения и биологические жидкости больного, некоторые субстраты внешней среды и др. (см. таблицу 5). При микробиологической диагностике инфекционных заболевании необходимо соблюдать основное правило: материал, подлежащий ис­следованию, берут в зависимости от патогенеза данного заболевания, срока заболевания и путей выделения возбудителя из организма боль­ного.

Исследуемые материалы для бактериологического исследования следует брать у больного до начала лечения антибактериальными пре­паратами (антибиотиками, химиопрепаратами, бактериофагами) или после прекращения их действия. При необходимости пробы для ис­следования берут повторно.

Материалы берут с помощью стерильных тампонов, ректальных трубок, специальных металлических петель, шприцов и т.п., помеща­ют в стерильную посуду, которую тщательно укупоривают и достав­ляют в бактериологическую лабораторию. От момента взятия материала до посева должно пройти не более 2-х часов. Для продле­ния этого срока необходимо поместить исследуемые пробы в консер­вирующие жидкости или в транспортные среды (особенно при выделении шигелл) с последующем хранением их в холодильнике.

Таблица 5. Исследуемые материалы при ОКИ, вызываемых знтеробактериями

Диареегенные эшерихии — возбудители кишечной коли-инфекции

Таксономия и классификация

Эшерихии - наиболее распространенные аэробные бактерии кишечника, способные при определенных условиях вызывать обширную группу заболеваний человека, как кишечной (диарея), так и внекишечной (бактеремия, инфекции мочевыводящих путей и др.) локализации. Семейство Enterobacteriaceae, род Escherichia, основной вид - E. coli (кишечная палочка) - самый распространенный возбудитель инфекционных заболеваний, вызываемых энтеробактериями.  Вид Е. coli не является однородным, а подразделяется на подвиды. Различают услов­но-патогенные эшерихий и диареегенные, обладающие вирулентностью.

Условно-патогенные эшерихии входят у чело­века в состав микрофлоры кишечника и вла­галища. Е. coli также составляют микрофлору толстого кишечника млекопитающих, птиц, рептилий, рыб. С испражнениями микроб выделяется в ок­ружающую среду. Присутствие кишечной палоч­ки в воде, почве, продуктах, предметах обихода является показателем фекального загрязнения, особенно воды. Коли - титр и коли - индекс часто использовали как санитарные показатели.

Нозологические формы

Условно-патогенные Е. coli способны вы­зывать эндогенные гнойно-воспалительные процессы различной локализации, назы­ваемые парентеральными эшерихиозами. Парентеральный эшерихиоз может проте­кать в виде сепсиса, нагноения ран, вторич­ной пневмонии, инфекции моче вы водящих путей. Часто возникает на фоне иммунодефицита.

Штаммы Е. coli, вовлеченные в инфекцион­ный процесс нижних отделов мочевыводящих путей, обладают специфическим О-антигеном, позволяющим им адгезироваться на поверх­ности эпителия мочевого пузыря. Те штаммы Е. coli, которые вызывают инфекцию верхних отделов мочевыводящих путей (пиелонефрит), имеют особые Р-фимбрии, обладающие ан­тигенными свойствами. Эти Р-фимбрии позволяют микробу адгезироваться на эпителии собирательных канальцев. Е. coli, вызывающие инфекцию мочевыводящих путей, чаще отно­сятся к серогруппам O2, Об, O9. Некоторые из них обладают гемолитической активностью за счет наличия Н1у-плазмиды.

Подавляющее число (около 80 %) менинги­тов новорожденных вызваны Е. coli, которой новорожденный заражается через родовые пути. Е. coli, вызывающая неонатальный ме­нингит, часто обладает микрокапсулой, со­стоящей из гомополимера сиаловой кислоты. Наличие микрокапсулы придает возбудителю антифагоцитарные свойства, так как мик­роб перестает опсонизироваться из-за потери способности активировать комплемент.

Из условно-патогенных Е. coli могут форми­роваться полирезистентные к антибиотикам штаммы за счет приобретения R-плазмид, которые становятся возбудителями ВБИ. Патогенные Е. coli, которые являются воз­будителями кишечного эшерихиоза, ОКИ, получили название диареегенных.