Принципы организации системы органов государственной власти субъектов РФ (ОГВС РФ) определены Конституцией РФ, ФЗ «Об общих принципах организации законодательных (представительных) и исполнительных органов государственной власти субъектов РФ» (1999 г.).

Деятельность ОГВС РФ основывается на принципах государственной и территориальной целостности РФ, распространения суверенитета РФ на всю ее территорию, верховенства Конституции РФ и ФЗ на всей территории РФ, единства системы государственной власти, разделения властей, разграничения предметов ведения и полномочий между органами государственной власти РФ и субъектов РФ, самостоятельного осуществления своих полномочий ОГВС РФ и МСУ. Систему ОГВС РФ составляют законодательный (представительный) ОГВС РФ (ЗОГВС РФ), высший исполнительный ОГВС РФ (ВИОГВС РФ), иные исполнительные ОГВС РФ (предусмотренные конституцией (уставом) и законами субъекта РФ). В субъекте РФ, в соответствии с уставом субъекта РФ и законами субъекта РФ, может также создаваться конституционный (уставный) суд субъекта РФ.

Число депутатов, структура и срок полномочий законодательного органа государственной власти субъектов РФ (но не более 5 лет, не менее 50 % депутатов избираются по пропорциональной избирательной системе) устанавливаются конституцией (уставом) субъекта РФ. Законодательный орган государственной власти субъектов РФ принимает конституцию (устав) субъекта РФ, законы субъекта РФ, осуществляет иные полномочия в соответствии с федеральным законодательством, конституцией (уставом) и законодательством субъекта РФ.

Решение о наделении гражданина РФ полномочиями высшего должностного лица субъекта РФ (ВДЛС РФ) (руководителя высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ) принимается законодательным органом государственной власти субъектов РФ, по представлению Президента РФ. Если региональный парламент трижды отклонит кандидатуру, он может быть распущен Президентом РФ, который вправе своим указом назначить временно исполняющего обязанности ВДЛС РФ (руководителя высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ).

Высшее должностное лицо субъекта РФ представляет соответствующий субъект РФ в отношениях с ФОГВ, ОГВС РФ, ОМС, формирует высший исполнительный орган государственной власти субъекта РФ, подписывает и обнародует законы субъекта РФ, исполняет другие полномочия.

Высший исполнительный орган государственной власти субъекта РФ обеспечивает исполнение Конституции РФ, федерального законодательства и иных федеральных нормативных правовых актов, конституции (устава) субъекта РФ, законов и иных актов субъекта РФ на территории соответствующего субъекта РФ, разрабатывает проект бюджета субъекта РФ (для его представления высшего должностного лица субъекта РФ в законодательный орган государственной власти субъектов РФ), управляет и распоряжается собственностью субъекта РФ, управляет федеральной собственностью, переданной в управление данного субъекта РФ, формирует иные органы исполнительной власти субъекта РФ.

Законодательный орган государственной власти субъектов РФ может принимать участие в формировании высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ, утверждении (согласовании) назначения на должность отдельных должностных лиц высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ в соответствии с конституцией (уставом) и законодательством субъекта РФ.

До решения соответствующего вопроса судом Президент РФ вправе приостановить действие акта высшего должностного лица субъекта РФ либо акта исполнительного органа государственной власти субъекта РФ, если таковой противоречит Конституции РФ, ФЗ, международным обязательствам РФ либо нарушает права и свободы человека и гражданина.