Контролюючими органами у сфері оподаткування згідно з Податковим кодексом України (далі ПКУ) є:

- органи державної фіскальної служби - щодо податків, які справляються до бюджетів та державних цільових фондів;

- митні органи - щодо мита, акцизного податку, податку на додану вартість, інших податків, які відповідно до податкового законодавства справляються у разі ввезення (пересилання) товарів і предметів на митну територію України або територію вільної митної зони або вивезення (пересилання) товарів і предметів з митної території України або території вільної митної зони.

До 2012 року до складу контролюючих органів у сфері оподаткування відносились: органи Державної податкової служби, органи Державної митної служби, органи Пенсійного фонду та органи Фондів загальнообов’язкового державного соціального страхування.

 Указом Президента України № 726 від 24.12.2012 р. «Про деякі заходи з оптимізації системи центральних органів виконавчої влади» було утворено Міністерство доходів і зборів України шляхом реорганізації Державної податкової служби України та Державної митної служби України. Окрім того, на новостворене Міністерство було покладено функцію адміністрування єдиного внеску на загальнообов'язкове державне соціальне страхування, який раніше (згідно з ПКУ) був виключений зі складу податків і зборів, а контроль за правильністю і своєчасністю його сплати не входив до компетенції органів Державної податкової служби.

Проте, Міндоходів було ліквідоване згідно з Постановою КМ України від 01.03.14 №67 "Про ліквідацію Міністерства доходів і зборів" і відновлено діяльність Державної податкової служби та Державної митної служби.

Наступним кроком стало утворення Державної фіскальної служби України згідно з Постановою КМ України від 21.05.2014 р. №160 "Про утворення Державної фіскальної служби" в межах повноважень і затверджених видатків по Міністерству доходів і зборів.

Органами стягнення є виключно органи державної фіскальної служби, які уповноважені здійснювати заходи щодо забезпечення погашення податкового боргу в межах їх повноважень, а також державні виконавці в межах своїх повноважень. Стягнення податкового боргу за виконавчими написами нотаріусів не дозволяється.

Відповідно до законодавства у сфері оподаткування інші державні органи не мають права проводити перевірки своєчасності, достовірності, повноти нарахування та сплати податків і зборів, митних платежів та єдиного соціального внеску, у тому числі за запитами правоохоронних органів.

Місце органів державної фіскальної служби України у системі органів управління, основні завдання, функції, територіальна структура органів визначається Постановою  Кабінету Міністрів України від 21 травня 2014 року № 160 "Про утворення Державної фіскальної служби". Державна фіскальна служба України є центральним органом виконавчої влади, діяльність якого координується Кабінетом Міністрів України.

Державна фіскальна служба України (ДФСУ) є головним органом у системі центральних органів виконавчої влади з питань:

- забезпечення формування єдиної державної податкової, державної митної політики в частині адміністрування податків і зборів, митних платежів та реалізації єдиної державної податкової, державної митної політики;

- адміністрування єдиного внеску на загальнообов'язкове державне соціальне страхування (далі - єдиний соціальний внесок);

- боротьби з правопорушеннями при застосуванні податкового та митного законодавства, а також законодавства з питань сплати єдиного внеску.

ДФСУ у своїй діяльності керується Конституцією та законами України, актами і дорученнями Президента України, щорічним посланням Президента України до Верховної Ради України, актами Кабінету Міністрів України, іншими актами законодавства України.