Высшим органом ВТО является Конференция министров, которая проводится не реже, чем раз в два года. Конференция министров уполномочена принимать решения по всем вопросам любого из многосторонних соглашений. Министерская конференция (или Генсовет) назначает Генерального директора ВТО. Эту должность сейчас занимает 5ый Генеральный директор Паскаль Лами, занявший должность 1 сентября 2005 года на срок 4 года.[6]

Второй уровень: Генеральный совет. В Генеральный совет (собирается несколько раз в год в штаб-квартире в Женеве в составе представителей членов ВТО, обычно послов и глав делегаций стран-участниц)  в соответствии с соглашением, учреждающим ВТО, входят все члены организации. Помимо выполнения регулярной работы от имени Конференции министров, Генеральный совет также действует в двух особых формах: в качестве органа разрешения споров, который контролирует применение процедур урегулирования споров, а также в форме органа обзора торговой политики для подготовки регулярных обзоров торговой политики отдельных членов ВТО. Все три органа подчинены Конференции министров и представляют ей доклады о своей деятельности.[7]

Третий уровень: Генеральный совет делегирует полномочия трем другим основным органам:[8]

· Совету по торговле товарами, который, в свою очередь, руководит деятельностью специализированных комитетов, осуществляющих контроль за соблюдением принципов ВТО и выполнением соглашений ГАТТ-1994 в сфере торговли товарами. Совету по торговле товарами подчиняются 11 специализированных комитетов. В них входят представители всех членов ВТО.

· Совету по торговле услугами, осуществляющий контроль за выполнением соглашения ГАТС. В его составе находятся Комитет по торговле финансовыми услугами и Рабочая группа по профессиональным услугам. Состав органов, подотчетных совету по торговле услугами, менялся в соответствии с необходимостью поддержки тех или иных переговоров.

· Совету по торговым аспектам интеллектуальной собственности помимо осуществления контроля за выполнением соответствующего соглашения (ТРИПС), занимается также вопросами предотвращения возникновения конфликтов, связанных с международной торговлей поддельными товарами.

Кроме того, Генеральному совету подотчетны комитеты по торговле и развитию; по ограничениям, связанным с торговым балансом; по бюджету, финансам и административным вопросам. Все члены ВТО представлены в каждом из комитетов. Генеральному совету также подчиняются несколько рабочих групп; комитеты по соглашениям с ограниченным числом участников, которые занимаются отдельными соглашениями системы ВТО и решением вопросов в таких областях, как защита окружающей среды, проблемы развивающихся стран, процедура присоединения к ВТО и региональные торговые соглашения.

Четвертый уровень: Органу разрешения споров подотчетны:

· апелляционный орган,

· третейские группы,

создаваемые для рассмотрения возникающих торговых споров.

Исполнительным органом организации является Секретариат ВТО в Женеве, в структурных подразделениях которого занято 635 человек. В обязанности Секретариата входит обслуживание органов ВТО, которые отвечают за проведение переговоров и реализацию соглашений. Секретариат оказывает техническую помощь развивающимся, прежде всего наименее развитым странам. Экономисты и статистики ВТО готовят аналитические обзоры состояния торговли и торговой политики, а юристы Секретариата оказывают помощь в разрешении торговых споров, связанных с толкованием правил ВТО и имеющихся прецедентов. Другие функции Секретариата включают оказание помощи в проведении переговоров о присоединении к организации новых членов и консультирование правительств по вопросам членства.[9]

Рабочие языки ВТО - английский, французский и испанский.

Бюджет организации на 2006 год составляет 175 млн. швейцарских франков.[10] Взносы членов рассчитываются исходя из их доли в мировой торговле.

Основными направлениями деятельности ВТО является обеспечение выполнения правил многосторонней торговли, включая правила разрешения споров, а также организация и проведение торговых переговоров. Помимо этого ВТО работает в следующих направлениях:

ü Помощь развивающимся странам и странам с переходной экономикой

ü Специализированная помощь в развитии экспорта

ü Сотрудничество в формировании глобальной экономической политики

ü Наблюдение за национальной торговой политикой

ü Помощь развивающимся странам и странам с переходной экономикой

Наблюдение за торговой политикой, проводимой государствами-членами, - одно из основных направлений всей деятельности ВТО. Центральным элементом этой работы является механизм по обзору торговой политики (МОТП).

Цели, которые стоят перед организацией на этом направлении, заключаются в том, чтобы, используя механизм регулярного мониторинга, способствовать прозрачности и пониманию торговой политики и мер, принимаемым в этой области, содействовать повышению качества общественных и межправительственных дискуссий по вопросам торговли и обеспечивать проведение международной оценки того воздействия, которое эта политика оказывает на систему мировой торговли. Таким образом, правительства государств-членов получают стимул строже подходить к выполнению правил ВТО и соблюдать взятые на себя обязательства.

Рассмотрение обзоров осуществляется на регулярной, периодической основе. Четыре крупнейших участника мировой торговли, а именно Европейский Союз, Соединенные Штаты Америки, Япония и Канада, проходят процедуру рассмотрения обзоров их торговой политики примерно раз в два года. Еще шестнадцать стран, которые следуют за ними согласно их доле в мировой торговле, проходят процедуру рассмотрения каждые четыре года, а остальные страны - каждые шесть лет, при этом для наименее развитых стран предусматривается возможность проходить процедуру рассмотрения обзоров их торговой политики реже. Рассмотрение обзоров проводится специальным Органом по проведению обзора торговой политики (ООТП), который создается на том же уровне, что и Генеральный совет. Этому органу представляются два документа: официальное заявление правительства, в котором излагаются основные положения торговой политики, и подробный доклад, который готовится отдельно Секретариатом ВТО. Оба документа, а также протоколы рассмотрения обзора торговой политики публикуются после окончания заседаний, на которых проходило рассмотрение торговой политики той или иной страны.[11]