Финансовые органы осуществляют контроль над формированием внебюджетных фондов, распределением денежных средств из этих фондов, определением объектов финансирования и т.д.

Министерство финансов Российской Федерации в соответствии с Положением о нем, утвержденным постановлением Правительства РФ от 6 марта 1998 г. № 273, осуществляет финансовый контроль за рациональным и целевым расходованием бюджетных средств и средств государственных (федеральных) внебюджетных фондов.

Положением о Федеральном казначействе Российской Федерации органам Федерального казначейства предоставлены определенные полномочия по управлению внебюджетными фондами.9 Главными задачами единой централизованной системы Федерального казначейства служат организация, осуществление и контроль за исполнением республиканского бюджета РФ, а также регулирование финансовых отношений между республиканским бюджетом РФ и государственными средств.

Казначейство занимается также сбором, обработкой и анализом информации о состоянии государственных финансов, оно представляет высшим законодательным и исполнительным органам государственной власти и управления РФ отчетность о финансовых операциях Правительства РФ, о государственных (федеральных) внебюджетных фондах, а также о состоянии бюджетной системы России.

В настоящее время функционирование государственных внебюджетных фондов в России характеризуется наличием большого числа проблем, требующих немедленного решения.[13]

Пенсионная система нашей страны на сегодняшний день состоит из государственного Пенсионного фонда РФ, негосударственных пенсионных фондов и различных управляющих компаний. В сфере пенсионного обеспечения имеются следующие проблемы:

- негативная тенденция к снижению покупательской способности пенсии;

- сокращение дифференциации размеров пенсий, связанное с сокрытием застрахованными лицами доходов от уплаты в пенсионное страхование;

- снижение стимулов к выплате страховых взносов в пенсионную систему.

Фонд социального страхования РФ занимает второе место по объему накопленных средств среди государственных внебюджетных фондов после Пенсионного Фонда РФ.

Среди общих проблем системы социального страхования России можно выделить:

- дублирование функций, отсутствие отлаженной взаимосвязи с социальной защитой и системами обязательного медицинского и пенсионного страхования;

 - отсутствие единой законодательной базы для всех видов систем обязательного социального страхования;

 - отсутствие актуарных расчетов для определения размера страховых тарифов;

- применение заниженного по сравнению с социальными стандартами размера страховых выплат в связи с материнством, особенно для неработающих женщин.

Составной частью государственной социальной поддержки населения выступает обязательное медицинское страхование, ключевым звеном осуществления которого является Федеральный фонд обязательного медицинского страхования.

Основные проблемы деятельности современной системы ОМС можно условно разделить на 2 вида: финансовые и организационные.

К основным финансовым проблемам относятся:

- нехватка денежных средств, связанная с отсутствием в стране ощутимого экономического роста и сохранением в настоящее время остаточного принципа финансирования здравоохраненческой отрасли;

- низкий тариф страховых взносов в ПФР в части средств на обязательное медицинское страхование работающего населения;

- недостаточность финансирования системы обязательного медицинского страхования на страхование неработающей части населения.

Для России на сегодняшнем этапе основным ориентиром в рамках деятельности государственных внебюджетных фондов служит выявление новых направлений и перспектив их развития. Без решения этой задачи невозможно дальнейшее функционирование и развитие государственных внебюджетных фондов как составной части финансовой системы РФ и важнейшего элемента общеэкономического развития государства и социального обеспечения граждан РФ.