Один из путей отнесения гаплотипа – это построение дерева гаплотипов (в данном случае в 67-маркерном варианте, представленный гаплотип это позволяет) и посмотреть, вписывается ли гаплотип в ветви дерева, или ему на дереве нет места, и он «высовывается» в виде непристроенного одиночки. Оказалось, что гаплотип, приведенный выше, комфортно располагается как на 67-маркерном дереве М269 (среди составляющих его гаплотипов субкладов М269*, L23, L51 и L151), так и на 67-маркерном дереве U106. Здесь звездочка М269* означает, что М269 – терминальный субклад, и нижестоящих снипов на соответствущей Y-хромосоме не обнаружено.
На рисунке приведено 67-маркерное дерево из 597 гаплотипов древних субкладов М269*, L23, L51 и L151. Представленный гаплотип оказался в отдельной ветви в верхней правой части дерева, куда указывает угол квадратика с буквой X. Эта ветвь развернута на последующей диаграмме, где гаплотип отмечен той же буквой X. Как видно, он сидит там довольно комфортно, что показывает, что гаплотип не чужой для этой ветви.
Ветвь, в которой находится представленный гаплотип, состоит из 56 гаплотипов, с базовым (предковым) гаплотипом
13 24 14 11 11 14 12 12 12 13 13 29 – 17 9 10 11 11 25
15 19 29 15 15 16 17 – 11 11 19 23 16 15 18 17 36 38
12 12–11 9 15 16 8 10 10 8 10 10 12 23 23 16 10 12
12 15 8 12 22 20 13 12 11 13 11 11 12 12
от которого представленный гаплотип отличается на 14 мутаций. Этот показатель нам пригодится в данном описании в дальнейшем. Всего в ветви от базового гаплотипа имеется 941 мутация, что показывает, что общий предок ветви жил 941/56/0.12 = 140 → 163 условных поколения (по 25 лет) назад, то есть 4075 ± 430 лет назад. Число мутаций (14) от этого предкового гаплотипа в целом согласуется, в пределах погрешности расчетов, с тем, что представленный гаплотип – прямой потомок общего предка ветви.
Дерево из 597 гаплотипов древних субкладов гаплогруппы Rlb-M269 и нижестоящих субкладов L23, L150, L51, Р310, Р311, CTS4528, CTS7822 и CTS9216 в 67-маркерном формате (дерево в 111-маркерном формате показано на другом рисунке). Острая ветвь слева вверху – это примесные гаплотипы, случайно попавшие в список (составлен на основе Проекта FTDNA ht35, из списка которого выбраны только 67-маркерные гаплотипы, и добавлен представленный гаплотип, приведенный выше, обозначенный индексом X). Все гаплотипы дерева имеют общего предка, который жил 4660 ± 470 лет назад (практически та же датировка, что для 111-маркерных гаплотипов, 4580 ± 460 лет назад). Ветвь справа наверху из 56 гаплотипа, в которую входит гаплотип X, имеет общего предка, который жил 4075 ± 430 лет назад. Гаплотипы взяты из проекта ht35[235]
Гаплотип, помеченный X, комфортно сидит на ветви дерева в ближайшем окружении ряда гаплотипов, которые представляют дилемму – или X относится к М269*, или к нижестоящему субкладу R1b-U106. Такая возможность была проверена, построив дерево из 829 гаплотипов субклада U106 в 67-маркерном формате, и добавив к нему представленный гаплотип.
Дерево из 829 гаплотипов субклада U106 в 67-маркерном формате, к которым добавлен представленный для экспертизы гаплотип, обозначенный индексом X. Все гаплотипы дерева имеют общего предка, который жил 3780 ± 380 лет назад (практически та же датировка, в пределах погрешности расчетов, что для 111-маркерных гаплотипов, 3580 ± 360 лет назад). Ветвь справа наверху из 15 гаплотипов, в которую входит гаплотип X, имеет общего предка, который жил 3000 ± 370 лет назад. Гаплотипы взяты из проекта[236]
Базовый (предковый) гаплотип ветви, в которую входит гаплотип X, имеет вид
13 23 14 11 11 14 12 12 12 13 13 29 – 17 9 10 11 11 24
15 19 29 15 15 17 17 – 11 10 19 23 17 15 17 17 36 39
12 12–11 9 15 16 8 10 10 8 10 10 12 22 23 16 10 12
12 15 8 12 22 20 13 12 11 13 11 11 13 12
в нем отмечены и мутаций от представленного гаплотипа. Как мы видим, представленный гаплотип ближе к соответствующей ветви субклада U106, чем субклада М269*. Это не означает, что отнесение гаплотипа завершено, но это показывает, что нашему коллеге желательно протестироваться на субклад U106.
Дата: 2019-03-05, просмотров: 208.
