Основаниями для рассмотрения судом вопросов, связанных с исполнением приговора, являются: ходатайство реабилитированного, ходатайство осужденного, представление органа внутренних дел, представление учреждения или органа, исполняющего наказание и др.

В судебное заседание вызывается представитель учреждения, исполняющего наказание, или компетентного органа иностранного государства, по обращению которого разрешается вопрос о передаче лица, осужденного в Российской Федерации, для отбывания наказания в государстве, гражданином которого оно является. Вопрос об участии в судебном заседании осужденного разрешает суд. В судебном заседании вправе участвовать также прокурор.

Осужденный, если он допущен к участию в судебном заседании, имеет право знакомиться со всеми представленными в суд материалами, участвовать в их рассмотрении, заявлять отводы судье, прокурору, а также представителю учреждения или органа, исполняющего наказание. Он вправе, кроме того, ходатайствовать об истребовании дополнительных материалов, о вызове в суд определенных лиц, представлять документы и давать объяснения. Принадлежащие ему права он может осуществлять с помощью адвоката. Суд не вправе отказать ему в этом. Адвокат так же, как осужденный, имеет право знакомиться с представленными суду материалами, участвовать в их рассмотрении, заявлять отводы и ходатайства, представлять документы, предлагать формулировку решения суда по рассматриваемому вопросу.

При разрешении вопроса о досрочном освобождении осужденного от отбывания наказания по болезни, инвалидности и т. д. в судебном заседании обязательно участие представителя медицинского учреждения, давшего соответствующее заключение.

Рассмотрение вопроса по существу начинается с доклада представителя учреждения или органа, подавшего в суд представление, либо с объяснения осужденного, законного представителя, близких родственников и адвоката, если вопрос рассматривается по их ходатайству. Вслед за этим исследуются материалы, представленные суду, а затем лица, явившиеся в судебное заседание, дают объяснения, прокурор излагает свое мнение, после чего судья в совещательной комнате выносит мотивированное постановление.

Само судебное заседание начинается с объяснений лица, представившего в суд ходатайство о снятии с него судимости. После этого исследуются материалы, представленные им и другими лицами, участвующими в судебном заседании (прокурором, адвокатом, законным представителем, участковым инспектором и т. д.). В обоснование своего ходатайства лицо, отбывшее наказание, представляет копию приговора, справку учреждения или органа, исполняющего наказания, об отбытии им наказания, а также справки и характеристики с места жительства, работы или учебы и другие документы, характеризующие его с положительной стороны.

После исследования материалов суд выслушивает прокурора и иных лиц, участвующих в судебном заседании, которые характеризуют лицо, претендующее на снятие судимости, на основании имеющейся у них информации и высказывают свое мнение по вопросу о снятии судимости. В заключение судья выносит мотивированное постановление о снятии судимости либо об отказе в снятии судимости. В последнем случае новое ходатайство о снятии судимости может быть заявлено не ранее чем по истечении года со дня отказа в удовлетворении ходатайства.

Законность, обоснованность и справедливость постановления суда по вопросу, связанному с исполнением приговора, могут быть оспорены посредством обращения заинтересованных лиц с жалобой, а прокурора с представлением в суд апелляционной или кассационной инстанции.

Разрешение вопросов, связанных с исполнением судебного решения, осуществляется под строгим судебным контролем. Большой объем указанных в ст. 397 УПК РФ этих вопросов все чаще наводит на мысль о выделении этой деятельности в особое производство, поручив его производство пенитенциарным судьям. Специальный пенитенциарный судья в ранге мирового судьи мог бы, по мнению некоторых ученых, осуществлять в упрощенных формах рассмотрение жалоб и заявлений заключенных, представлений прокурора и администрации мест лишения свободы.